區塊鏈:區塊鏈+基因檢測可行？不暴露個人信息就能測序基因組！

來源|Wired編譯|火火醬責編|Carol出品|區塊鏈大本營

通過使用區塊鏈技術，NebulaGenomics公司為客戶設計了一種無需透露個人身份數據就能測序基因組的方法。

當生物學研究人員晚上入睡時，他們通常會夢到基因組。你的、我的、以及我們之間“六度分離理論”所涉及的所有人。

想想，所有包含在這60億個遺傳密碼字母中的基因信息，正是這些基因信息讓你成為了獨一無二的你。只要科學家能夠收集到足夠的信息，那么就能找到藏在DNA中的那些摧毀致命疾病的方法。

到目前為止，全球至少有2600萬人部分基因組已經被解碼了——大部分是由23andMe和Ancestry這樣的公司破解的，但其中很大部分是屬于部分解碼，只有一小部分被全部解碼。

聲音 | 楊蓓蓓：支持區塊鏈在知識產權領域的應用:1月7日， 北京市第17期局級領導干部研修一班楊蓓蓓在北京日報刊文《用政策保障世界知識產權保護高地建設》。文章表示，世界知識產權保護高地的建設必須有強有力的機制體制支撐和改革措施保障。其中包括突出北京科教引領的優勢。其一是支持區塊鏈在知識產權領域的應用，在申請、保護和交易環節分別用區塊鏈技術進行版權登記、存證、維權與簽署智能合約。[2020/1/7]

在十年前的2009年，破解一個完整的基因組會花費10萬美元，如今，可能只要1000美元。業界有企業認為，到2021年，還將有可能低破100美元。那么，所有的基因組都在哪里呢？有一些聲音認為，未來的測序師已經被“個人數據隱私”這個因素給嚇跑了。

動態 | 廣東擬在6市部署食用農產品區塊鏈溯源系統:近日，據廣東省市場監管局負責人介紹，廣州黃沙水產品交易市場已經試點將區塊鏈技術應用于食品溯源暨銷售憑證系統，在此試點的基礎上，將成功經驗向全省推廣，深圳、汕頭、佛山、惠州、湛江、肇慶等6市先行先試，預計年底前，6市80%以上的水產品經營者將使用食用農產品區塊鏈溯源系統。[2019/11/7]

NebulaGenomics的首席技術官KevinQuinn表示，在2018年Facebook/CambridgeAnalytica丑聞爆出后不久，隱私保護的大覺醒就開始了。“人們開始意識到，他們每天使用的服務并沒有按照預期的方式進行，”他說，“這對基因學領域造成了很大的沖擊。”

23andMe的CEOAnneWojcicki也表示，對隱私的擔憂是DNA檢測銷量下滑的主要原因。包括Nebula在內的幾家新興企業試圖通過將人們的DNA放在區塊鏈上的方式來解決這些問題。

動態 | 江西省今年上半年經營范圍有區塊鏈新登記企業為27戶 同比增長28.6%:據人民網江西頻道7月12日消息，在新技術上，江西省以數字經濟為代表的六大重點產業發展較為迅速。江西省今年上半年經營范圍有物聯網、大數據及云計算、虛擬現實、軟件及信息技術服務、區塊鏈和人工智能新登記企業分別為380戶、232戶、31戶、10302戶、27戶和101戶，同比分別增長41.3%、47.8%、287.5%、31.1%、28.6%和102%。[2019/7/12]

這家新興企業是由哈佛基因組學先驅GeorgeChurch參與聯合創辦的，去年年初推出時，以99美元的價格提供低質量的基因組測序服務，并將數據訪問控制寫入公共賬本中。

今年夏天，他們增加了一個“贊助測序”模型，如果客戶讓Nebula與醫藥合作伙伴共享鑒定的DNA和其他數據，那么該模型將為客戶提供免費的臨床級基因組檢測。之后，該公司推出了該領域的第一個“匿名測序”程序，該程序旨在實現個人信息完全匿名化。

聲音 | BM：應該多思考區塊鏈對于現有商業的應用:據 IMEOS 報道，BM 在 EOS 黑客馬拉松現場圓桌討論時談及對區塊鏈的看法時表示，我們不應該嘗試去尋找新的東西來應用區塊鏈，而是應該多思考區塊鏈對于現有商業的應用。[2018/12/5]

當你從23andMe或Ancestry這樣的公司訂購唾液采集包時，必須使用信用卡付款并輸入地址。你需要用郵箱注冊賬號來查看結果。所有這一切都是在互聯網瀏覽器上完成的。

并且，所有的數據都與唾液管內旋轉的DNA相關聯，很快就會變成一個由短字符As、Cs、Ts和Gs組成的數據文件。在公司與想要挖掘這些基因數據的研究人員或制藥公司分享這些數據之前，他們必須剝離掉所有的這些個人標識。

動態 | 韓國公共機關為引進區塊鏈系統而增加投標:7月6日消息，首爾經濟報道稱，韓國公共機關為引進區塊鏈系統而增加投標。據了解，韓國公共機關想要直接利用區塊鏈技術，在資金流入相關產業后，激活國內區塊鏈生態系統。今年上半年，地方政府和公共機關向區塊鏈企業發出的招標公告達22份。去年全年共發布了15個區塊鏈招標公告，僅今年上半年就超過了去年引進的嘗試。[2018/7/6]

Nebula已經做到了，但是Quinn說，顧客必須相信所有東西都能得到妥善地清理，并且不會有人把事情搞砸。匿名測序的理念從最一開始就是與個人信息相分離的。

這就是為什么匿名測序的第一步就是更為全面地清理你的電子商務習慣。Nebula建議使用加密電子郵件，并使用VPN掩蓋你的瀏覽行為。

而且，你必須要有一個與你的名字無關的地址，POBox在這時就可以派上用場了。安全的加密錢包或者預加載的信用卡也是必不可少的。完成所有步驟后，你就可以匿名購買并收到Nebula唾液采集包了。該公司對你的基因組進行測序，然后將其放到他們的安全云中，沒有人會知道這組基因屬于誰。

Quinn說：“我們這邊不需要去識別它屬于誰，因為它本質上已經是獨立的了。以前從來沒有人這么做過。”該公司表示，雖然這個流程建立在“不信任Nebula”的基礎上，但它實際上是在建立信任。我知道這聽起來是有點反常理，但是，這畢竟是區塊鏈嘛。

只有一個很小的雙螺旋型問題。基因組本身就是一個獨一無二的標識符，但是，近年來，研究人員發現，使用公共數據庫，僅通過DNA來識別個人身份的可能性越來越高。“如果你有60億對堿基對，你還管別人叫什么干嘛？那本身就是一個更獨特的標識符了啊，”生物信息學家MarkGerstein說道。

為了防止黑客從DNA基因組存儲庫中竊取數據，并將其與其他數據結合以重新識別人的身份，應該對數據進行加密，但是這僅僅是數據安全的第一步。

Gerstein提到，問題在于讀取基因組需要將其與其他人的DNA進行比較，這也是了解其中字母含義的唯一方法。對基因組進行加密后，它也會對所有軟件保持加密狀態，而這些軟件本會告訴你“你的祖先來自哪里”或者“你的APOE4版本是否會讓你更容易患上阿爾茨海默癥”。

“這個過程是需要計算才能理解的，這意味著基因組需要在服務器和數據庫之間移動。在不揭示基礎序列的情況下要這么做是非常棘手的。”因為基因組數據非常龐大。銀行號碼、納稅申報單、醫療記錄等都是小文件。

所以，提供knowledge-lessstorage的公司可以對該數據進行加密，并提供唯一的密鑰。對整個基因組進行加密的計算成本要高得多，而在加密的基因組上運行計算的成本則會更高。

但這正是Nebula下一步要做的工作。在過去的一年中，Nebula一直在與研究人員合作以構建和測試安全的計算環境，相關的出版物目前正在接受審核。

該公司計劃從明年開始部署這項技術，首先使用該公司自己的基因組解釋服務，該服務將向客戶介紹他們的健康狀況和祖先血統，最終與學術和制藥研究合作伙伴合作。目前，這些計算在Nebula存儲基因組數據的分布式網絡上進行。

合作伙伴可以提交查詢，并且只能查看查詢結果。只有Nebula和基因組所有者才可以訪問純文本數據。最終想要實現的功能是，即使是Nebula也將無權訪問，只有基因組所有者才能訪問。

盡管Gerstein是個愛吹毛求疵的人，但他面對這一進展仍感到十分激動。他說：“就開發真正的私有基因組測序和儲存的選擇而言，這一步意義重大。”因為他預計在不久的將來，測序將會像測血壓一樣成為醫生辦公室的家常便飯。現在將這些保護措施規范化或許有助于防止日后出現更強的反對和抵制。

科學家們，祝你們好夢！

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